Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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