Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF4Q15306 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms