Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms