Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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