Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC3Q14574 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms