Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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