Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM25Q14258 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms