Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF1Q14162 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms