Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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COL4A6Q14031 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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