Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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