Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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TUBB2AQ13885 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBB2AQ13885 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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