Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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