Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms