Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.646e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-220ENST00000497031 560 ntTSL 318.89■□□□□ 0.615e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.575e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ELP6-206ENST00000442215 1277 ntTSL 518.38■□□□□ 0.536e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SUMF2-213ENST00000451338 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.2■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.55e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-217ENST00000490426 1027 ntTSL 218.13■□□□□ 0.495e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.496e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ZNF271P-204ENST00000639141 1865 ntTSL 217.63■□□□□ 0.415e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-214ENST00000483795 1913 ntTSL 217.19■□□□□ 0.345e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-214ENST00000633367 876 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.335e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.245e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 LRBA-208ENST00000510157 1636 ntTSL 516.45■□□□□ 0.226e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.135e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.129e-33■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.115e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TRAPPC4-205ENST00000525079 768 ntTSL 315.43■□□□□ 0.065e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SUMF2-218ENST00000529457 568 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.035e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.055e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.085e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PSMC6-203ENST00000551328 650 ntTSL 214.06□□□□□ -0.163e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 POLR2H-211ENST00000488213 1035 ntTSL 213.19□□□□□ -0.38e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 URM1-201ENST00000372847 753 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.365e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AC078927.1-201ENST00000539652 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GATAD2A-205ENST00000418032 3480 ntTSL 211.86□□□□□ -0.515e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-209ENST00000544599 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ZNF271P-203ENST00000638208 2191 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.695e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.095e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 LRBA-213ENST00000515096 2914 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.16e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.26e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.245e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-210ENST00000545407 1303 ntTSL 57.29□□□□□ -1.245e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.256e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 C19orf53-205ENST00000592760 357 ntTSL 37.19□□□□□ -1.266e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.295e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.335e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 LRBA-203ENST00000503716 3712 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.346e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PSMC6-212ENST00000556813 785 ntTSL 55.92□□□□□ -1.463e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-210ENST00000465527 787 ntTSL 25.68□□□□□ -1.55e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-206ENST00000538217 552 ntTSL 25.3□□□□□ -1.565e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.565e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-207ENST00000460720 582 ntTSL 24.82□□□□□ -1.645e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 327.52■■■□□ 25e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 212.92□□□□□ -0.349e-33■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.22e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EIF3E-203ENST00000518345 558 ntTSL 310.79□□□□□ -0.687e-15■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EIF3E-204ENST00000518442 1285 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.737e-15■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EIF3E-202ENST00000518100 687 ntTSL 58.65□□□□□ -1.027e-15■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EIF3E-216ENST00000522887 575 ntTSL 47.34□□□□□ -1.237e-15■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EIF3E-205ENST00000518634 545 ntTSL 55.64□□□□□ -1.517e-15■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.932e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 220.83■□□□□ 0.932e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.312e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 57.41□□□□□ -1.223e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 CAPNS1-202ENST00000586851 616 ntTSL 38.29□□□□□ -1.085e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-204ENST00000527148 684 ntTSL 224.98■■□□□ 1.591e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.471e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 222.63■■□□□ 1.211e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-206ENST00000530807 498 ntTSL 219.21■□□□□ 0.671e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-209ENST00000532718 668 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.581e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SLC39A4-205ENST00000529462 2778 ntTSL 216.98■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 311.25□□□□□ -0.614e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AL049779.1-203ENST00000554493 364 ntTSL 26.33□□□□□ -1.44e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AL049779.1-202ENST00000553582 498 ntTSL 25.78□□□□□ -1.484e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.624e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AL049779.1-204ENST00000557564 274 ntAPPRIS P1 TSL 2-1.88□□□□□ -2.714e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-10■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.796e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.936e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.936e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.726e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 215.95■□□□□ 0.146e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.372e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-231ENST00000634602 544 ntTSL 416.93■□□□□ 0.37e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-232ENST00000634609 553 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.217e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-239ENST00000635278 597 ntTSL 215.89■□□□□ 0.137e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-217ENST00000482261 1149 ntTSL 515.89■□□□□ 0.137e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-221ENST00000494767 1023 ntTSL 515.89■□□□□ 0.137e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-237ENST00000635194 582 ntTSL 515.51■□□□□ 0.077e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-204ENST00000418549 558 ntTSL 415.39■□□□□ 0.057e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-242ENST00000635443 1053 ntTSL 515.33■□□□□ 0.047e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-235ENST00000634953 583 ntTSL 414.97□□□□□ -0.017e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-233ENST00000634724 754 ntTSL 214.13□□□□□ -0.157e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-218ENST00000482438 600 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.227e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-244ENST00000635501 1290 ntTSL 213.51□□□□□ -0.257e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-243ENST00000635494 568 ntTSL 413.2□□□□□ -0.37e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 QARS-246ENST00000635622 701 ntTSL 313.08□□□□□ -0.327e-6■■□□□ 12.3
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