Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHAF1BQ13112 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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