Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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