Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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