Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms