Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDR1Q08345 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDR1Q08345 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms