Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CXCL9Q07325 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CXCL9Q07325 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms