Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms