Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms