Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms