Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms