Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms