Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms