Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms