Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HBBP68871 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HBBP68871 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HBBP68871 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HBBP68871 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HBBP68871 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HBBP68871 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HBBP68871 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms