Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms