Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GNB1P62873 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GNB1P62873 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GNB1P62873 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms