Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms