Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OXCT1P55809 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms