Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEMP55040 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEMP55040 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEMP55040 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEMP55040 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEMP55040 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEMP55040 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms