Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms