Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP5P51878 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP5P51878 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP5P51878 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms