Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR4P51571 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR4P51571 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR4P51571 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR4P51571 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR4P51571 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR4P51571 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR4P51571 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms