Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms