Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSBP45954 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms