Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms