Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA1P29973 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms