Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms