Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTX3P26022 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms