Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms