Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms