Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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