Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB9P17482 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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