Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms