Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RLBP1P12271 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms