Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms