Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms